Investigadores de la Facultad de Química y del Instituto de Química Teórica y Computacional (IQTC) de la Universitat de Barcelona (UB) han descubierto cinco moléculas de compuestos naturales que inhiben la proteasa principal -Mpro- del virus SARS-CoV-2, la proteína que ayuda el coronavirus a replicarse.
El trabajo, que publica la revista 'Journal of Chemical Information and Modeling' y ha sido dirigido por el catedrático Jaime Rubio Martínez, abre nuevas perspectivas para diseñar estrategias terapéuticas en la lucha contra la Covid-19.
El nuevo avance científico se ha conseguido usando la criba virtual (in silico), una técnica de análisis computacional para seleccionar moléculas candidatas a futuros fármacos en una biblioteca química.
Así, han encontrado moléculas de productos naturales que son capaces de inhibir el Mpro, la principal proteasa del virus SARS-CoV-2, una proteína no estructural que tiene un papel esencial en la replicación y transcripción de este virus y que se considera una potencial diana terapéutica, puesto que si se pudiera inhibir podría evitar la progresión del virus.
Actualmente, el tratamiento de la Covid-19 consiste a tratar sus síntomas mediante agentes antiinflamatorios (por ejemplo, la dexametasona o inhibidores de citoquines) combinados con antibióticos para tratar infecciones secundarias.
También se ha aprobado el antiviral ritonavir, pero todavía hay necesidad de nuevos medicamentos y por eso los científicos han puesto en marcha varias estrategias para identificar compuestos bioactivos que se puedan utilizar como agentes terapéuticos (incluidos los fármacos disponibles y los productos naturales).
En este contexto, la criba virtual es un procedimiento fiable, rápido y eficiente para descubrir compuestos bioactivos de grandes colecciones químicas contra un objetivo molecular específico o diana.
En esta investigación, el equipo de la UB ha llevado a cabo una criba virtual de la base de datos Selleck de productos naturales -una biblioteca química con cerca de 2.000 compuestos- para ver si hay alguna que inhiba la proteasa Mpro del virus SARS-CoV-2, mediante simulaciones y un ensamblaje molecular virtual.
Se trata de un método bioinformático que permite predecir y calcular con técnicas computacionales la posición más favorable de interacción entre uno ligando y su proteína diana.
De esta forma seleccionaron once compuestos y probaron in vitro su capacidad de inhibir la proteasa Mpro y finalmente han identificado cinco candidatos antivirales SARS-CoV-2, inhibidores de la proteasa Mpro, a partir de la base de datos de productos naturales.